Le deuxième grand volet d’activités du laboratoire est la recherche. Celle-ci s’articule autour de trois principaux thèmes :

- Fonctionnement écologique des milieux aquatiques ;
- Biologie et écologie des ressources aquatiques vivantes (faune et flore)
- Aquaculture


Ces diverses études visent deux principaux objectifs :

- Une meilleure connaissance des écosystèmes aquatiques et de leur biodiversité en vue de leur gestion rationnelle ;
- Une valorisation des ressources aquatiques vivantes à des fins aquacoles


Programmes de recherche déjà exécutés ou en cours